丙型肝炎病毒非结构蛋白NS5A反式激活基因NS5ATP7的克隆

• 作者: 刘妍 刘敏 张健 成军 梁耀东 王琳 邵清
• 来源期刊: 世界华人消化杂志
• 学科: 医学
• 年，卷（期）: 2004,（1）
• 所属期刊栏目: 病毒性肝炎
• 页码范围: 82-85
• 页数: 4页
• 分类号: R575
• 字数: 4780字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1009-3079.2004.01.021

摘要

目的:应用抑制性消减杂交(SSH)技术及生物信息学技术筛选并克隆丙型肝炎病毒(HCV)非结构蛋白5A(NS5A)反式激活新型靶基因.方法:以HCV NS5A表达质粒pcDNA3.1(-)-NS5A转染HepG2细胞,以空载体pcDNA3.1(-)为平行对照,提取mRNA并进行SSH分析.对于所获基因片段序列分析表明,其中之一为新型基因片段,与GenBank中注册的已知功能基因序列没有同源性,利用表达序列标签(EST)序列的搜索和比对,进行电子拼接,根据基因起始密码子的Kozak规则和终止密码子下游保守的多聚腺苷酸信号序列,确定新型基因序列.从HepG2细胞提取总RNA,以逆转录多聚酶链反应(RT-PCR)技术扩增获得该新基因的全长序列,并测序证实,命名为NS5ATP7,在GenBank中注册,注册号为AF529368.结果:NS5ATP5基因的编码序列全长为894个核苷酸(nt),编码产物由297个氨基酸残基(aa)组成.结论:HCV NS5A反式激活新型靶基因NS5ATP5的筛选与克隆,为进一步研究HCV NS5A反式激活作用的分子生物学机制和探索新型治疗技术奠定了基础.