大规模板栗疫病菌cDNA文库的特征和冗余序列的排除

• 作者: 吴晓松 商巾杰 姚姿婷 范云燕 蒋莹 陈保善 陈辉
• 来源期刊: 广西农业生物科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 低毒病毒/板栗疫病菌 cDNA文库 高丰度克隆 原位杂交
• 年，卷（期）: 2005,（4）
• 所属期刊栏目: 生物技术专栏
• 页码范围: 275-282
• 页数: 8页
• 分类号: Q781
• 字数: 5087字
• 语种: 中文

摘要

低毒病毒/板栗疫病菌是一个研究病毒宿主相互作用的优良的实验系统.为了更好的了解病毒与宿主相互作用的机制,我们建立了一个野生型无病毒板栗疫病菌菌株EP155和受低毒病毒感染的菌株EP713的cDNA混和文库,以进行表达序列标签(EST)测定.对543个克隆的外源片段的分析表明,该文库克隆中含外源片段的比例为89.8%;通过小规模测序,发现空质粒与小片段克隆占测序总数的10.1%;表达丰度最高的4个克隆出现次数的总和占测序总数的9.6%.通过设计引物进行PCR和原位杂交,对cDNA文库2万多个克隆进行了筛选,共筛除了占总数19.7%的空质粒与小克隆和5.5%的高丰度克隆,为高效率的大规模EST测序准备了条件.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈保善	广西大学生命科学与技术学院	56	223	9.0	13.0
4	商巾杰	广西大学生命科学与技术学院	3	6	2.0	2.0
11	范云燕	广西大学生命科学与技术学院	2	15	2.0	2.0
12	吴晓松	广西大学生命科学与技术学院	1	3	1.0	1.0
13	蒋莹	广西大学生命科学与技术学院	1	3	1.0	1.0
14	姚姿婷	广西大学生命科学与技术学院	1	3	1.0	1.0
15	陈辉	广西大学生命科学与技术学院	1	3	1.0	1.0