WSSV 3个编码蛋白的基因密码子偏爱性分析

• 作者: 刘庆慧 韩文君 黄倢
• 来源期刊: 海洋水产研究
• 学科: 农学
• 关键词: WSSV 密码子 偏爱性
• 年，卷（期）: 2005,（4）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 1-7
• 页数: 7页
• 分类号: Q755|S945.4+6
• 字数: 2343字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-7075.2005.04.001

摘要

运用EMBOSS(The European Molecular Biology Open Software Suite) 的CHIPS(Condon Heterozygosity in a Protein Coding Sequence)和CUSP( Create a condon usage table)程序对WSSV 3个编码蛋白的基因密码子偏爱性分析,分析结果与大肠杆菌、酵母及人的密码子偏爱性进行比较.结果显示,WSSV-vp37、WSSV-vp39及WSSV-vp19的Nc(Effective number of condons)值为49.897、48.640、46.868.3种蛋白的编码密码子使用频率有较大的差异,其在大肠杆菌、酵母及人的密码子偏爱性也有不同,分析结果表明,WSSV-vp37和WSSV-vp39的密码子与原核生物及人的相差较大,其表达系统选择在酵母较为合适,而WSSV-vp19的密码子与原核和真核生物酵母相差较大.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	黄倢	中国水产科学研究院黄海水产研究所	111	1805	25.0	37.0
2	刘庆慧	中国水产科学研究院黄海水产研究所	25	370	9.0	19.0
3	韩文君	中国水产科学研究院黄海水产研究所	5	76	4.0	5.0