禽呼肠病毒3个编码蛋白的基因密码子偏爱性分析

• 作者: 刘加波 庞耀珊 谢丽基 谢芝勋 邓显文
• 来源期刊: 动物医学进展
• 学科: 农学
• 关键词: 禽呼肠病毒 密码子 偏爱性
• 年，卷（期）: 2007,（12）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 19-23
• 页数: 5页
• 分类号: S852.659.4
• 字数: 2112字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1007-5038.2007.12.004

摘要

应用EMBOSS的CHIPS和CUSP程序对禽呼肠病毒(ARV)3个编码蛋白的基因密码子偏爱性进行分析,其结果与大肠埃希菌、酵母及人的密码子偏爱性进行比较.结果显示,ARVσC、ARVσB和ARVσNS的Nc(Effective number of condons)值为56.689、56.457和51.532.3种蛋白的部分编码密码子使用频率有较大的差异,其与大肠埃希菌、酵母及人的密码子偏爱性也有不同,表明ARVσC和ARVσNS的密码子与原核生物及人的相差较大,其表达系统选择在酵母较为合适,而ARVσB的密码子与原核生物较近,其表达系统选择在大肠埃希菌较为合适.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘加波		118	1407	21.0	29.0
2	谢芝勋		139	1616	23.0	31.0
3	庞耀珊		118	1412	21.0	30.0
4	邓显文		118	1428	21.0	30.0
5	谢丽基		73	730	16.0	23.0