PJ综合征疾病基因STK11/LKB1转录调控的生物信息学分析

• 作者: 周世权 姚茂金 宁文锋 施小六 汤建光 王永俊 莫烨
• 来源期刊: 中国医师杂志
• 学科: 医学
• 关键词: Peutz-Jeghers综合征 STK11/LKB1 转录调控 生物信息学
• 年，卷（期）: 2005,（2）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 145-147
• 页数: 3页
• 分类号: R5
• 字数: 2251字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.1008-1372.2005.02.001

摘要

目的初步了解STK11/LKB1的转录起始位点信息,分析其可能的候选启动子区段,为以后进行STK11/LKB1的转录调控研究作准备.方法通过检索网上数据库资料,获得STK11/LKB1的转录本信息;运用MethPrimer和FirstEF两种程序,对包含STK11/LKB1基因"第一外显子"、"第一内含子"及其5'UTR区上游的gDNA片段序列,分别进行CpG岛分析和第一外显子预测;利用PromoterInspector等预测程序,对STK11/LKB1的启动子进行预测.结果目前已知的STK11/LKB1转录本中,5'UTR区最长的序列为BC007981(GenBank登录号);STK11/LKB1基因属于典型的CpG岛相关基因,现有的"第一外显子" 之5'上游已不再有外显子,已有的5'UTR区基本已基本接近STK11/LKB1的转录起始位点;在BC007981的5'上游约200bp到400bp内很可能存在有启动子.结论 STK11/LKB1已有的5'UTR区基本已基本接近STK11/LKB1的转录起始位点,在BC007981的5'上游数百bp内很可能能找到具有启动活性的区段从而有利于进行下一步的转录调控研究.实验明确其真实的转录起始位点应已相对容易.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	施小六	中南大学湘雅二医院消化内科	22	53	4.0	5.0
2	姚茂金	中南大学湘雅二医院消化内科	11	103	6.0	10.0
3	王永俊	中南大学湘雅二医院消化内科	10	46	4.0	6.0
4	汤建光	中南大学湘雅二医院消化内科	21	65	5.0	6.0
5	周世权	中南大学湘雅二医院消化内科	7	33	3.0	5.0
6	莫烨	中南大学湘雅二医院神经内科	2	23	1.0	2.0
7	宁文锋	中南大学湘雅二医院消化内科	3	27	2.0	3.0