肝细胞癌高表达基因cDNA文库的构建及生物信息学分析

• 作者: 景丽 朱争艳 杜智 王毅军 聂福华 阚学锋 高英堂
• 来源期刊: 生物技术通讯
• 学科: 生物学
• 关键词: 肝细胞癌 抑制性消减杂交 cDNA文库 生物信息学
• 年，卷（期）: 2006,（4）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 520-525
• 页数: 6页
• 分类号: Q75|Q78
• 字数: 5823字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1009-0002.2006.04.011

摘要

目的:构建肝细胞癌的高表达基因cDNA文库并进行相应的生物信息学分析.方法:应用抑制性消减杂交(SSH)技术,以7对肝癌组织和癌旁组织为实验材料,构建肝癌高表达基因的cDNA文库;使用BioEdit、BLAST和EGAD等软件进行生物信息学分析.结果:获得1 450个白色阳性克隆,经PCR扩增后均有100～1 000 bb的插入片段,经杂交验证选取125个克隆进行测序;经BLAST、EGAD等生物信息学工具分析获得基因83个,其中细胞分裂相关基因5个,参与细胞信号转导或通讯的基因5个,参与细胞结构或运动的基因7个,细胞或器官防御相关基因11个,参与细胞内基因转录或蛋白表达的基因22个,代谢相关基因18个,另有15个未归类基因.结论:利用SSH技术可构建肝细胞癌组织差异表达基因的消减cDNA文库,为进一步深入探讨肝癌的诊断、治疗和预后评估等提供更多的分子指标.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杜智		134	751	13.0	20.0
2	聂福华		39	129	8.0	9.0
3	朱争艳		49	200	8.0	10.0
4	高英堂		56	319	8.0	15.0
5	王毅军		92	408	11.0	14.0
6	阚学锋		3	17	2.0	3.0
7	景丽		19	59	5.0	7.0