人类博卡病毒基因组序列与进化分析

• 作者: 何志雄 刘巧突 夏承来 廖端芳 张治明 戴国知 林应标 罗迪贤 许灿新
• 来源期刊: 实用预防医学
• 学科: 医学
• 关键词: 人类博卡病毒 基因组 生物信息学 突变 序列分析
• 年，卷（期）: 2006,（6）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 1430-1432
• 页数: 3页
• 分类号: R3
• 字数: 1806字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1006-3110.2006.06.011

摘要

目的 对人类博卡病毒的基因组结构、系统进化以及突变规律进行分析.方法 利用生物信息学方法如BLAST、CLUSTALW等程序对已经提交到GenBank数据库中的人类博卡病毒全基因组序列进行比对分析和系统进化分析.结果 人类博卡病毒基因组短小、结构简单;与其它博卡病毒基因组同源性高,尤其是犬细小病毒;目前GenBank中的5株人类博卡病毒根据进化关系分析可分为两群(CRD2、st2、CZ643和st1组成一群,WLL-1单独成群);统计突变发现人类博卡病毒NS1基因突变频率最小,VP1/2基因突变频率高.结论 人类博卡病毒很可能是动物博卡病毒传染给人后的变种;稳定的NS1基因很可能成为开发疫苗和防治药物的重要靶点.