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摘要:
针对趋势相关(两基因在其表达水平随时间上升与下降的变化趋势上相关)关系在重建基因调控网络中十分重要却尚未被挖掘利用的问题,提出了几何模式动态贝叶斯网络(Gp-DBN)方法.Gp-DBN将每个基因的表达数据转换为一个几何模式,依据几何模式确定潜在的调控子和调控时滞,并通过推理这些几何模式之间的相关关系来发现基因间的调控关系.该方法解决了挖掘具有趋势相关的基因调控关系的问题,能够很大程度地提高重建的基因调控网络的性能.对Yeast和E. coli基因数据的实验结果表明无论是在无先验知识还是在有先验知识时Gp-DBN重建的基因调控网络的性能都比传统的动态贝叶斯网络方法有大幅度提高.
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文献信息
篇名 几何模式动态贝叶斯网络推理基因调控网络
来源期刊 西安电子科技大学学报(自然科学版) 学科 工学
关键词 几何模式 动态贝叶斯网络 基因调控网络
年,卷(期) 2007,(6) 所属期刊栏目
研究方向 页码范围 922-925,943
页数 5页 分类号 TP18
字数 5077字 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.1001-2400.2007.06.014
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 张军英 西安电子科技大学计算机学院 113 2001 25.0 41.0
2 赵峰 西安电子科技大学计算机学院 21 231 9.0 14.0
3 张宏怡 西安电子科技大学计算机学院 5 47 3.0 5.0
4 王开军 西安电子科技大学计算机学院 5 338 5.0 5.0
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研究主题发展历程
节点文献
几何模式
动态贝叶斯网络
基因调控网络
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
西安电子科技大学学报(自然科学版)
双月刊
1001-2400
61-1076/TN
西安市太白南路2号349信箱
chi
出版文献量(篇)
4652
总下载数(次)
5
总被引数(次)
38780
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:the National Natural Science Foundation of China
官方网址:http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:数理科学
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