基于隐马尔可夫模型的DNA序列识别

• 作者: 宋丽红 朱思铭 李艳会 罗泽举
• 来源期刊: 华南理工大学学报（自然科学版）
• 学科: 工学
• 关键词: 隐马尔可夫模型 DNA序列 内含子 外显子 识别 快速训练算法
• 年，卷（期）: 2007,（8）
• 所属期刊栏目: 数学科学
• 页码范围: 123-126
• 页数: 4页
• 分类号: TP18|O29
• 字数: 3292字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-565x.2007.08.025

摘要

利用隐马尔可夫模型训练中不同结构的DNA序列的L值分布范围不同的特点,对传统多类投票模型进行改进,提出一种优于传统算法的快速训练算法,该算法只需训练出一类隐马尔可夫模型参数.对DNA内含子和外显子序列进行识别,平均识别率达到了90.8%.与支持向量机相比,隐马尔可夫模型在解决多分类问题方面具有优势,不但计算时间少,而且识别率高.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	朱思铭	中山大学数学与计算科学学院	94	573	13.0	20.0
2	罗泽举	重庆工商大学计算机科学与信息工程学院	27	147	7.0	11.0
3	宋丽红	重庆工商大学实验实习中心	17	94	6.0	9.0
4	李艳会	中山大学数学与计算科学学院	11	52	4.0	7.0