猪戊型肝炎病毒株swGX32全基因组序列分析

• 作者: 吉彦莉 唐荣兰 常义斌 庄辉 朱永红 李凌君 王玲 韦献飞
• 来源期刊: 中华微生物学和免疫学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 戊型肝炎病毒 猪 基因型 人畜共患病
• 年，卷（期）: 2008,（5）
• 所属期刊栏目: 病毒学
• 页码范围: 421-425
• 页数: 5页
• 分类号: R3
• 字数: 3721字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0254-5101.2008.05.010

摘要

目的 分析从广西地区分离的1株猪戊型肝炎病毒swGX32全基因组序列并比较其与其他分离株的差异.方法 设计PCR引物,用巢式反转录聚合酶链反应法(RT-nPCR)分段扩增戊型肝炎病毒(HEV)株swGX32全基因序列,用cDNA末端快速扩增法(RACE)扩增其末端序列,对扩增产物进行克隆和测序,并对拼接后的基因组进行序列和进化分析.结果 除3′polyA尾巴外,swGX32全长7240 nt, ORF1与ORF2重叠4 nt, ORF3包含在ORF2序列中.swGX32全基因序列与HEV1～4型核苷酸序列的同源性分别为:73%～74%、73%、74%～75%,83%～94%,其中与中国人源HEV株JKO-ChiSai98C同源性最高,达94%.全基因序列进化分析显示,swGX32位于HEV基因4型分枝上,ORF2部分核苷酸序列进化分析显示,swGX32与JKO-ChiSai98C同在HEV 4a亚型分枝上.结论 猪HEV swGX32在全基因组结构及分子进化上均与人HEV JKO-ChiSai98C有密切关系,为揭示戊型肝炎是一种人兽共患病提供了分子生物学依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王玲	北京大学医学部病原生物学系	100	465	10.0	17.0
2	庄辉	北京大学医学部病原生物学系	273	2534	26.0	43.0
3	唐荣兰		7	52	4.0	7.0
4	韦献飞		4	9	2.0	3.0
5	朱永红	北京大学医学部病原生物学系	22	317	7.0	17.0
6	吉彦莉	北京大学医学部病原生物学系	4	37	3.0	4.0
7	李凌君	北京大学医学部病原生物学系	4	35	3.0	4.0
8	常义斌	北京大学医学部病原生物学系	1	3	1.0	1.0