猪OLR1基因克隆及生物信息学分析

• 作者: 刘春伟 孙超
• 来源期刊: 西北农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: OLR1 猪 克隆 生物信息学 密码子偏好性
• 年，卷（期）: 2008,（5）
• 页码范围: 51-55
• 页数: 5页
• 分类号: S828.2
• 字数: 4240字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1004-1389.2008.05.012

摘要

设计猪氧化低密度脂蛋白受体1(OLR1)基因编码区全长引物,从猪脂肪组织中扩增OLR1基因编码区全长序列,对其蛋白质序列进行比对分析,预测蛋白质信号肽位点及结构域并研究该基因密码子使用偏好性.结果表明:猪OLR1基因编码区全长为825 bp,共编码273个氨基酸,猪OLR1基因与牛同源性最高(84%),其次是人(79%)、大鼠(51%)和小鼠(27%).猪OLR1蛋白38～60位氨基酸为信号肽所在位置,144～256位氨基酸正是C型凝集素家族共有结构域;OLR1基因密码子A+U含量(61.2%)远高于G+C含量(38.8%),而且偏向使用A/U结尾的密码子(占76.53%),这可能影响到OLR1基因的表达水平.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	孙超	西北农林科技大学动物科技学院	70	417	12.0	16.0
2	刘春伟	西北农林科技大学动物科技学院	4	27	3.0	4.0