中华大蟾蜍生长相关蛋白(GAP-43)编码序列的克隆与生物信息学分析

• 作者: 俞诗源 冯军基 刘忠虎 岳晓慧 相玺玺 童川
• 来源期刊: 西北师范大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 中华大蟾蜍 生长相关蛋白(GAP-43) 编码序列 克隆测序 系统进化
• 年，卷（期）: 2009,（4）
• 所属期刊栏目: 生命科学
• 页码范围: 81-86
• 页数: 6页
• 分类号: Q954.62
• 字数: 4397字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-988X.2009.04.018

摘要

通过RT-PCR技术获得了中华大蟾蜍(Bufo gargarizans)脑组织生长相关蛋白(GAP-43)编码序列,将该序列及其推导的氨基酸序列与其它13个物种已知的相应序列进行同源性和遗传距离分析,并构建系统进化树.结果表明:中华大蟾蜍GAP-43编码序列大小是654 bp,比非洲爪蟾(Xenopus laevis)大6 bp,二者GAP-43编码序列同源性为76.6%;中华大蟾蜍与除斑马鱼(Danio rerio)外的其它12个物种在GAP-43编码序列两端具有保守性,与非洲爪蟾遗传距离最近,为0.234;尽管中华大蟾蜍与哺乳动物氨基酸序列间存在明显差异,但其钙调素结合位点、磷酸化位点和N端质膜结合位点等功能域仍具有保守性;GAP-43氨基酸序列构建的进化树符合传统动物分类学特点.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	俞诗源	西北师范大学生命科学学院	141	1058	16.0	24.0
2	刘忠虎	河南农业大学牧医工程学院	36	244	10.0	14.0
3	岳晓慧	河南农业大学牧医工程学院	5	19	3.0	4.0
4	冯军基	河南农业大学牧医工程学院	4	12	2.0	3.0
5	童川	河南农业大学牧医工程学院	4	13	2.0	3.0
6	相玺玺	河南农业大学牧医工程学院	2	6	1.0	2.0