黄瓜cpSSR-PCR反应体系优化及应用

• 作者: 侯卫真 李建吾 梁芳芳 胡建斌 董小结 袁鸣
• 来源期刊: 分子植物育种
• 学科: 农学
• 关键词: 黄瓜 cpSSR 体系优化 单倍型
• 年，卷（期）: 2009,（4）
• 所属期刊栏目: 新思路、新技术、新方法
• 页码范围: 822-826
• 页数: 5页
• 分类号: S6
• 字数: 4183字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/mpb.007.000822

摘要

叶绿体微卫星(chloroplast microsatellite,cpSSR)是近几年发展起来的新型高效分子标记,在植物系统发育和基因漂移研究中有广泛应用.在前期开发黄瓜cpSSR引物的研究基础上,本文研究了Taq酶量、MgCl2浓度、dNTPs浓度、模板DNA质量和浓度、循环次数等参数对cpSSR-PCR扩增效果的影响,获得优化的反应体系,即15μL体积包括:1×Taq酶缓冲液,0.5UTaq聚合酶,0.2μmol/L引物,0.2mmol/LdNTPs,15 mmol/LMgCl2,约10 ng模板DNA,循环25次.采用该优化体系,以已开发的黄瓜cpSSR引物,对12份黄瓜材料进行了重复性PCR扩增.结果发现国外种质中存在3种单倍型,而在国内种质中只检测到2种单倍型,说明在本研究所用的材料中,国外种质叶绿体遗传差异明显大于国内栽培种.此结果说明优化的cpSSR反应体系具有稳定性和可靠性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李建吾	河南农业大学园艺学院	44	442	12.0	19.0
2	梁芳芳	河南农业大学园艺学院	27	51	4.0	6.0
3	胡建斌	河南农业大学园艺学院	59	510	12.0	20.0
4	袁鸣	河南农业大学园艺学院	2	22	2.0	2.0
5	董小结	河南农业大学园艺学院	1	2	1.0	1.0
6	侯卫真	河南农业大学园艺学院	1	2	1.0	1.0