巴马香猪Toll样受体4基因cDNA的克隆及生物信息学分析

• 作者: 安立龙 巨向红 徐汉进 效梅 许英梅 雍艳红
• 来源期刊: 中国实验动物学报
• 学科: 医学
• 关键词: 猪 Toll样受体 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2010,（3）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 185-190,后插1
• 分类号: R349.64
• 字数: 4707字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1005-4847.2010.03.002

摘要

目的 研究TLR4在猪自然免疫中的作用及机制,为抗病育种及免疫佐剂的开发提供依据.方法 利用NCBI公布的TLR4基因序列设计引物,RT-PCR技术克隆巴马香猪TLR4基因.结果 所得基因序列提交GenBank,登录号:GQ304754.经序列分析,发现巴马香猪TLR4基因开放阅读框长2526 bp,编码785个氨基酸,该蛋白等电点为6.58,分子量为96.4×103;与普通猪比对发现巴马香猪TLR4基因有5个碱基发生突变;与小鼠、狗、鸡、牛、羊和人的同源性分别为71.9%、81.5%、54.2%、86.4%、85.5%和81.9%;TLR4膜外区蛋白为背侧多个α螺旋和内侧多个β折叠平行交替排列构成一个弯曲状螺旋结构;N末端存在信号肽,且可能在23～24位氨基酸处存在裂解位点;胞外区有13个明显的LRR,分别位于第53～74、77～100、101～124、149～173、174～192、201～225、372～393、398～429、446～469、470～494、495～518、519～541、543～566位氨基酸区;膜外区含8个N连接的糖基化位点.结论 本研究成功克隆巴马香猪TLR4基因,为进一步研究该基因的功能和蛋白质的特性奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	雍艳红	广东海洋大学动物医学系	24	105	7.0	9.0
2	效梅	广东海洋大学动物医学系	30	106	6.0	8.0
3	安立龙	广东海洋大学动物科学系	82	289	8.0	11.0
4	许英梅	广东海洋大学动物科学系	21	75	5.0	7.0
5	巨向红	广东海洋大学动物医学系	33	119	6.0	9.0
6	徐汉进	广东海洋大学动物科学系	5	16	2.0	4.0