基于多窗口不同特征的蛋白质相互作用位点预测

• 作者: 宋杨 王菲露
• 来源期刊: 安徽大学学报（自然科学版）
• 学科: 工学
• 关键词: 蛋白质相互作用位点 序列谱 信息熵 滑动窗口 支持向量机
• 年，卷（期）: 2010,（5）
• 页码范围: 64-68
• 分类号: TP391
• 字数: 3364字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2162.2010.05.013

摘要

识别蛋白质相互作用位点在蛋白质功能研究中发挥着重要作用.文章从蛋白质序列出发,提取相关特征--序列谱、序列谱+信息熵,分别形成多个滑动窗口,以此构造输入特征向量.采用"留一法"生成训练数据集和测试数据集,使用支持向量机构建6种分类器,预测测试集中的表面残基是否是蛋白质相互作用位点,得到了较好的结果,说明了实验方法的有效性和可行性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王菲露	安徽建筑工业学院电子与信息工程学院	12	32	3.0	5.0
4	宋杨	安徽建筑工业学院电子与信息工程学院	12	34	3.0	5.0