基于支持向量机的蛋白质相互作用位点预测

• 作者: 宋杰 杜秀全 王池社 王菲露
• 来源期刊: 计算机技术与发展
• 学科: 工学
• 关键词: 蛋白质相互作用 序列谱 残基信息窗 支持向量机
• 年，卷（期）: 2008,（10）
• 所属期刊栏目: 智能、算法、系统工程
• 页码范围: 127-129,132
• 页数: 4页
• 分类号: TP183
• 字数: 2437字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1673-629X.2008.10.037

摘要

蛋白质的功能常体现在生物大分子的相互作用中,识别蛋白质相互作用位点对于研究蛋白质功能发挥着重要作用.蛋白质问主要通过表面残基发生相互作用,蛋白质相互作用形成复合体时,只有部分表面残基参与了该过程.基于序列谱信息,提取序列上相邻残基的序列谱作为输入特征向量,对大小为3和7的残基信息窗(win3,win7),分别采用支持向量机(SVM)分类器对蛋白质相互作用位点进行预测、比较和分析.最终实验结果为:win3的平均正确率为69.31%,win7的平均正确率为69.68%.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王菲露	安徽大学计算智能与信号处理教育部重点实验室	2	4	1.0	2.0
5	宋杰	安徽大学计算智能与信号处理教育部重点实验室	66	596	10.0	23.0
6	王池社	安徽大学计算智能与信号处理教育部重点实验室	6	6	2.0	2.0
7	杜秀全	安徽大学计算智能与信号处理教育部重点实验室	12	38	3.0	5.0