运用PCR-DGGE分析比较瘤胃中不同饲料固相粘附微生物区系

• 作者: 冯薇 刘开朗 卜登攀 李旦 杨开伦 王加启 赵圣国
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 固相粘附微生物 DGGE 瘤胃
• 年，卷（期）: 2010,（12）
• 所属期刊栏目: 动物营养
• 页码范围: 1556-1562
• 分类号: S816.3
• 字数: 3821字
• 语种: 中文

摘要

通过研究奶牛瘤胃中苜蓿、青贮玉米和羊草3种饲料固相粘附微生物菌群结构,分析比较附着于不同粗饲料微生物区系的差异.选择3头健康且体质量相近的装有永久性瘤胃瘘管的中国荷斯坦奶牛,将苜蓿,青贮玉米和羊草分别装入尼龙袋,在瘤胃中孵育24 h后取出,PBS洗脱获得固相粘附微生物,提取总DNA,采用变性梯度凝胶电泳技术(DGGE)分析群落结构,选取清晰条带测序后构建系统发育树.不同样品的DGGE图谱条带的数目和条带颜色深浅有一定差异;苜蓿与青贮玉米和羊草间相比相似性较低,青贮玉米与羊草间的相似性较高;3种饲料及瘤胃内容物固相粘附微生物的Simpson多样性指数差异显著(P＜0.05),Shannon-Wiener多样性指数差异不显著(P＞0.05);3种饲料固相粘附微生物条带近源种分别归属Butyrivibrio sp.、Fibrobacter sp.、Prevotella sp.、Succiniclasticum sp.、Pseudobutyrivibrio sp.5个属.3种饲料固相粘附微生物的种群构成存在差异.