湖北钉螺肝胰腺cDNA文库的构建和序列分析

• 作者: 朱丹丹 聂品 赵琴平
• 来源期刊: 水生生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 湖北钉螺 肝胰腺 cDNA文库 EST
• 年，卷（期）: 2011,（4）
• 页码范围: 672-680
• 分类号: Q785
• 字数: 4775字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1035.2011.00672

摘要

以湖北钉螺肝胰腺为材料构建cDNA文库.文库初始滴度为5.6×104cfu/mL,库容量为6.72×105cfu/mL,重组率为93％.插入片段长度为400-2700bp.对其中1728个克隆进行测序,得到1520个序列,其中长度大于100 bp的ESTs为1393条,初步拼接得到698个单基因簇(Unigene),其中包括234个重叠群(Contig),464个单拷贝(Singleton)EST.使用BLAST软件进行同源性分析,结果显示有111个单基因簇具有不同程度的同源性,约占15.90％；587个单基因簇与所有已发现的蛋白质的基因没有或者有着相当低的同源性,约占84.10％.研究为湖北钉螺的基因学研究提供了重要的基础资料,同时亦为筛选和鉴定湖北钉螺生长发育、免疫等相关的功能基因以及血吸虫与螺之间的相互关系奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	聂品	中国科学院水生生物研究所淡水生态与生物技术国家重点实验室	65	861	13.0	28.0
2	赵琴平	武汉大学基础医学院	25	93	5.0	9.0
3	朱丹丹	中国科学院水生生物研究所淡水生态与生物技术国家重点实验室	7	15	2.0	3.0