基于网络拓扑的生物网络关键节点识别研究进展

• 作者: 李绍华 杜秀英 杨路明 王建新 陈建二 黄海滨
• 来源期刊: 数学的实践与认识
• 学科: 数学
• 关键词: 网络拓扑 生物信息 关键节点 识别 复杂网络
• 年，卷（期）: 2011,（7）
• 所属期刊栏目: 应用
• 页码范围: 114-125
• 分类号: O157.5
• 字数: 11880字
• 语种: 中文

摘要

与生物实验方法相比,基于网络拓扑的生物信息学方法在关键节点识别上有独特优势.基于网络拓扑的关键节点识别主要依赖节点在生物网络中的拓扑特性,通过观察节点网络拓扑参数的大小、所处的路径或模块的结构及其动力特性,在一定程度上可以对其关键性进行推断.从节点的中心性测度、网络的拓扑参数及层次结构等几方面总结了生物网络及其节点的主要拓扑特征;比较了蛋白质网络、代谢网络及基因调控网络关键节点识别的主要方法;分析了节点拓扑参数计算、路径求解及模块的划分及识别算法;指出生物网络关键节点识别上存在识别率不高、不同研究结论的不一致甚至相互矛盾、现有算法对网络规模日益增长的不适应等问题,并提出解决问题的思路及进一步研究的方向.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨路明	中南大学信息科学与工程学院	181	1754	20.0	35.0
2	王建新	中南大学信息科学与工程学院	371	3185	23.0	39.0
3	李绍华	中南大学信息科学与工程学院	20	197	8.0	13.0
5	黄海滨	玉林师范学院数学与计算机科学系	14	71	4.0	8.0