栗疫菌CpIAP基因生物信息学分析及功能研究

• 作者: 张林巧 徐晶 熊琴 王克荣 王奎杰 高坤
• 来源期刊: 南京农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 栗疫菌 凋亡抑制蛋白(IAPs) 致病性 产孢能力
• 年，卷（期）: 2011,（6）
• 页码范围: 59-64
• 分类号: S432.1
• 字数: 3591字
• 语种: 中文

摘要

寻找栗疫菌的凋亡抑制蛋白( inhibitor of apoptosis proteins,IAPs)类蛋白,明确该蛋白与其他物种IAPs的进化关系,并对CpIAP基因功能进行初步研究.以IAPs家族的典型结构域“BIR”为靶标,对栗疫菌基因组数据库进行BLAST搜索.运用生物信息学对预测的CpIAP蛋白结构进行分析并构建系统进化树；采用同源重组的策略,构建CpIAP基因缺失突变体,并重新导入该基因全长片段获得互补株.结果从栗疫菌中鉴定了1个IAP基因,Southern blot验证为单拷贝.生物信息学分析表明:CpIAP基因全长2 997 bp,编码920个氨基酸,具有2个BIR结构域；进化关系上CpIAP与人Survivin和酵母IAP较近.CpIAP敲除突变体命名为△IAP,△IAP菌落形态改变,生长速率减慢,致病力下降,丧失产孢能力.上述结果表明:CpIAP参与了栗疫菌的菌落形态建成、分生孢子形成和致病过程.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王克荣	南京农业大学农作物生物灾害综合治理教育部重点实验室	38	312	10.0	16.0
2	徐晶	南京农业大学农作物生物灾害综合治理教育部重点实验室	3	9	2.0	3.0
3	高坤	南京农业大学农作物生物灾害综合治理教育部重点实验室	1	3	1.0	1.0
4	张林巧	南京农业大学农作物生物灾害综合治理教育部重点实验室	1	3	1.0	1.0
5	熊琴	南京农业大学农作物生物灾害综合治理教育部重点实验室	1	3	1.0	1.0
6	王奎杰	南京农业大学农作物生物灾害综合治理教育部重点实验室	1	3	1.0	1.0