棉花品种资源群体结构与连锁不平衡分析

• 作者: 别墅 张友昌 张成 易先达 李成奇 秦鸿德
• 来源期刊: 棉花学报
• 学科: 农学
• 关键词: 陆地棉 数量性状位点 分子标记 连锁不平衡 群体结构
• 年，卷（期）: 2011,（6）
• 所属期刊栏目: 研究与进展
• 页码范围: 500-506
• 分类号: S562.024
• 字数: 3896字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-7807.2011.06.003

摘要

用基因组扫描的方法,利用棉花9个连锁群上的79个微卫星标记(Simple sequence repeat,SSR),对收集的204份陆地棉品种(系)组成的品种资源群体进行群体结构和连锁不平衡(Linkage disequilibrium,LD)分析.结果表明:本研究群体可划分为3个群体,其中两个群体分别由3个亚群体组成.群体中,47％的标记位点之间可以观察到显著的LD(P≤0.05).LD在遗传距离小于120 cM范围内普遍存在.在决定系数r2≤0.05时,LD在0.01单位的平均衰减距离为29.7cM,在r2≥0.05的条件下能观察到的LD最大遗传距离为31.4 cM,在r2≥0.1时能观察到LD的最大遗传距离缩小到3.4cM.群体的连锁不平衡状况表明本研究群体可用于重要育种性状的关联分析.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李成奇	河南科技学院生命科技学院	22	104	7.0	9.0
2	别墅	湖北省农业科学科院经济作物研究所	70	413	9.0	17.0
3	易先达	湖北省农业科学科院经济作物研究所	15	83	5.0	9.0
4	张友昌	湖北省农业科学科院经济作物研究所	26	103	6.0	9.0
5	张成	湖北省农业科学科院经济作物研究所	9	65	5.0	8.0
6	秦鸿德	湖北省农业科学科院经济作物研究所	5	10	2.0	3.0