鸭瘟病毒UL47基因克隆及其分子特性分析

• 作者: 崔恒敏 徐志文 朱德康 汪铭书 沈爱梅 王印 王小玉 程安春 罗丹丹 罗启慧 贾仁勇 陈孝跃
• 来源期刊: 中国兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 鸭瘟病毒 UL47基因 分子特性
• 年，卷（期）: 2011,（1）
• 所属期刊栏目: 预防兽医学
• 页码范围: 29-35
• 分类号: S852.65
• 语种: 中文

摘要

通过测定本实验室构建的鸭瘟病毒(Duck plague virus,DPV)DNA基因文库中重组质粒的DNA序列,结合NCBI的ORF Finder和Blast工具分析得到了该病毒UL47基因的ORF.采用PCR扩增出了UL47基因并将其克隆到pMD18-T载体上,经PCR和酶切鉴定以及进一步的核酸斑点杂交试验证实该基因即为DPV UL47基因.利用生物信息学软件ProtScale、SignalP3.0、Scansite、TMpred、Prosite、DNAStar以及在线的EMBOSS等分析了UL47基因的分子特性.结果显示,该基因大小为2 367 bp,编码788 aa,而且与GenBank上多种α疱疹病毒同源蛋白的核酸和氨基酸序列具有较高的同源性.系统进化树分析表明,DPV UL47与禽类疱疹病毒(α-疱疹病毒)的进化关系最近.密码子偏爱性结果显示,DPV UL47编码相同氨基酸的不同密码子使用频率差异较大,UL47基因密码子使用模式更接近真核生物.研究结果为进一步开展DPV UL47基因功能研究奠定了基础.