小鼠Reelin 基因启动子克隆鉴定及生物信息学分析

• 作者: 吴松泉 姜树原 张建军 张颜波 牛敬忠 邵国
• 来源期刊: 泰山医学院学报
• 学科: 医学
• 关键词: Reelin 启动子 生物信息学 DNA甲基化
• 年，卷（期）: 2012,（7）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 484-487
• 分类号: R-33
• 字数: 2245字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1004-7115.2012.07.002

摘要

目的 克隆小鼠Reelin基因启动子区并分析其潜在DNA甲基化位点和转录因子结合位点.方法 根据NCBI上小鼠Reelin 5'非翻译区序列设计引物,利用高保真PCR方法克隆昆明小鼠Reelin启动子区序列,并进行TA克隆,测序鉴定.利用亚硫酸氢钠处理基因组DNA,通过PCR技术和测序技术对Reelin启动子-636 bp至-135 bp序列甲基化情况分析.应用Methyl Primer Express software V1.0 和 TFSEARCH软件分析该区域甲基化位点和转录因子结合位点.结果 成功克隆了小鼠Reelin基因启动子区0至-450片段.甲基化测序分析小鼠Reelin启动子区-636 bp至-135 bp序列没有CpG二核苷酸被甲基化.小鼠 Reelin 翻译起始点0至-450片段利用CpG 岛序列分析软件分析显示,该区域C+G含量高达78.71%,CpG含量为14.44%.该区域有120多个潜在转录因子结合位点.结论 在小鼠Reelin基因启动子区0~-450发现有一个CpG岛和多个转录因子结合位点,该区域可能在小鼠Reelin基因表达调控起重要作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	牛敬忠	泰山医学院附属医院神经内科	73	427	11.0	16.0
2	姜树原	包头医学院生物医学研究中心	28	37	4.0	4.0
6	邵国	包头医学院生物医学研究中心	66	224	8.0	13.0
10	张颜波	泰山医学院附属医院神经内科	92	496	12.0	16.0
11	张建军		4	2	1.0	1.0
12	吴松泉	丽水学院医学院	15	34	2.0	5.0