辣椒NBS-LRR类型抗病基因同源序列的克隆及分析

• 作者: 万红建 侯喜林 杨悦俭 赵敬
• 来源期刊: 江苏农业学报
• 学科: 生物学
• 关键词: NBS-LRR 抗病基因同源序列 辣椒 克隆
• 年，卷（期）: 2012,（3）
• 所属期刊栏目: 园艺
• 页码范围: 611-616
• 分类号: Q78
• 字数: 4383字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-4440.2012.03.029

摘要

为研究辣椒NBS-LRR类抗病基因的结构和功能特点,运用前人根据NBS-LRR类抗病基因保守结构域(P-Loop和GLPL)设计的简并引物,以辣椒PBC631B的基因组DNA为模板进行PCR扩增,共获得17个具有完整开放阅读框的辣椒抗病基因同源序列(CaRGA0I～CaRGA17).多重序列比对显示这些序列都含有NBS-LRR类基因的6个保守结构域(P-loop、RNBS-A-nonTlR或RNBS-A-TIR、Kinase-2、RNBS-B、RNBS-C和GLPL).与已知6个抗病基因(Gpa2、L6、M、N、Prf和RPM1构建系统进化树,发现这17个序列被分为TIR-NBS-LRR和nonTlR-NBS-LRR2组,进一步划分为4个亚组(CaRGAⅠ～CaRGAⅣ).其中,CaRGA01和CaRGA13分别与来自番茄Solanum lycopersicum抗细菌性斑点病基因Bs4和番茄Solanum sp.VFNT抗线虫基因Mi-1.4相似性最高,分别为90%和91%,推测这2个序列可能是相关抗病基因的一部分或与相关抗病基因属于同一家族.这些结果将为研究辣椒抗病相关基因提供理论依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨悦俭	浙江省农业科学院蔬菜研究所	83	498	12.0	19.0
2	万红建	浙江省农业科学院蔬菜研究所	24	59	5.0	6.0
3	侯喜林	南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室	294	4133	31.0	48.0
4	赵敬	南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室	1	8	1.0	1.0