肠道病毒71型宁波分离株全基因组特征研究

• 作者: 王锦 许国章 顾文珍
• 来源期刊: 中国卫生检验杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 肠道病毒71型 全基因组 序列分析 同源性和亲缘进化分析
• 年，卷（期）: 2012,（2）
• 所属期刊栏目: 微生物检测方法
• 页码范围: 270-272,275
• 页数: 4页
• 分类号: R373.2
• 语种: 中文

摘要

目的:研究2010年肠道病毒71型宁波分离株的全基因组序列特征.方法:收集宁波市手足口病患者的粪便标本进行特异性荧光定量RT - PCR鉴定,EV71阳性标本进行病毒分离和全基因组序列的测定.结果:2010NB65株全长7406 bp,与参考株EV71相比编码区没有核苷酸的缺失和插入.2010NB65株与2008年-2010年中国大陆EV71流行株的各区段核苷酸和氨基酸同源性均较高,分别为94.1％ ～98.8％和97.6％～100％；与A型和CoxA16核苷酸同源性较低,分别为75.0％～ 82.4％和63.0％ ～ 85.4％.VP1和全基因组亲缘进化分析表明,2010NB65株属于CA基因亚型的C4a进化分支,与浙江株、阜阳株、北京株亲缘关系近.2010NB65株P2、P3区与CoxA16的进化途径相近.结论:宁波市HFMD患者粪便中分离得到EV71属于C4基因亚型的C4a进化分支,与我国其他地区的EV71存在共同进化趋势,全基因组序列提供了完整的分子生物学背景,为EV71病毒性疾病的防控提供参考价值.