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草鱼抗病毒基因Mx全长cDNA的克隆、序列分析与真核表达载体构建
草鱼抗病毒基因Mx全长cDNA的克隆、序列分析与真核表达载体构建
作者:
刘莉
刘鹏
吴海丽
江晨
王改改
采克俊
金佳丽
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
草鱼
Mx基因
克隆
序列分析
载体构建
摘要:
Mx蛋白是一类由I型干扰素(IFN)诱导表达的抗病毒蛋白。以PolyI∶C诱导的草鱼(Ctenopharyngodon indellus)肾细胞(CIK cells)为材料,抽提细胞总RNA,通过RT-PCR的方法扩增出Mx基因cDNA全序列,连接至pMD20-T载体上,构建重组质粒pMD20-T-Mx,并测序进行序列分析。用限制性内切酶从克隆的重组质粒pMD20-T-Mx上切下Mx基因,插入到质粒pEGFP-C1中,构建真核表达载体pEGFP-C1-Mx。结果显示,该基因cDNA全序列为1 921 bp,阅读框共编码627个氨基酸,分子量约为71.1 ku,理论等电点pI为8.33,其编码的Mx蛋白具有脊椎动物Mx蛋白共有的结构特征:一个三联体GTP结合区域和一个发动蛋白家族的典型结构特征序列。生物信息学分析表明,草鱼Mx基因所编码的蛋白质以亲水区域为主,具有丰富的B细胞抗原位点,但无明显的核定位序列,空间结构包括N端的GTP酶结构域(GTPase domain)、中间的中央相互作用结构域(central interactive domain,CID)和C端的GTP酶效应结构域(GTPase effector domain,GED)。同源性分析显示,草鱼Mx蛋白氨基酸序列和其他物种的相似性为45.1%~99.7%。此外还成功构建了含草鱼Mx基因cDNA全序列的真核表达载体pEGFP-C1-Mx。研究亮点:首次通过干扰素诱生剂PolyI∶C诱导草鱼肾细胞的方法克隆得到了草鱼抗病毒基因Mx cDNA全序列,并且借助生物信息学软件对其编码的氨基酸进行了序列分析,还成功构建了真核表达载体pEGFP-C1-Mx,为进一步研究草鱼Mx蛋白的生物学活性及其在抗鱼类病毒性疾病中的应用奠定基础。
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文献信息
篇名
草鱼抗病毒基因Mx全长cDNA的克隆、序列分析与真核表达载体构建
来源期刊
上海海洋大学学报
学科
农学
关键词
草鱼
Mx基因
克隆
序列分析
载体构建
年,卷(期)
2012,(4)
所属期刊栏目
水产生物技术
研究方向
页码范围
502-508
页数
分类号
S917
字数
语种
中文
DOI
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单位
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42
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金佳丽
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江晨
湖州师范学院生命科学学院
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王改改
湖州师范学院生命科学学院
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吴海丽
湖州师范学院生命科学学院
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湖州师范学院生命科学学院
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克隆
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载体构建
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研究分支
研究去脉
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期刊影响力
上海海洋大学学报
主办单位:
上海水产大学
出版周期:
双月刊
ISSN:
1004-7271
CN:
31-2024/S
开本:
大16开
出版地:
上海市军工路334号
邮发代号:
4-604
创刊时间:
1992
语种:
chi
出版文献量(篇)
2427
总下载数(次)
5
总被引数(次)
28460
相关基金
浙江省自然科学基金
英文译名:
官方网址:
http://www.zjnsf.net/
项目类型:
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学科类型:
期刊文献
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上海海洋大学学报2012年第6期
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上海海洋大学学报2012年第1期
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