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摘要:
Mx蛋白是一类由I型干扰素(IFN)诱导表达的抗病毒蛋白。以PolyI∶C诱导的草鱼(Ctenopharyngodon indellus)肾细胞(CIK cells)为材料,抽提细胞总RNA,通过RT-PCR的方法扩增出Mx基因cDNA全序列,连接至pMD20-T载体上,构建重组质粒pMD20-T-Mx,并测序进行序列分析。用限制性内切酶从克隆的重组质粒pMD20-T-Mx上切下Mx基因,插入到质粒pEGFP-C1中,构建真核表达载体pEGFP-C1-Mx。结果显示,该基因cDNA全序列为1 921 bp,阅读框共编码627个氨基酸,分子量约为71.1 ku,理论等电点pI为8.33,其编码的Mx蛋白具有脊椎动物Mx蛋白共有的结构特征:一个三联体GTP结合区域和一个发动蛋白家族的典型结构特征序列。生物信息学分析表明,草鱼Mx基因所编码的蛋白质以亲水区域为主,具有丰富的B细胞抗原位点,但无明显的核定位序列,空间结构包括N端的GTP酶结构域(GTPase domain)、中间的中央相互作用结构域(central interactive domain,CID)和C端的GTP酶效应结构域(GTPase effector domain,GED)。同源性分析显示,草鱼Mx蛋白氨基酸序列和其他物种的相似性为45.1%~99.7%。此外还成功构建了含草鱼Mx基因cDNA全序列的真核表达载体pEGFP-C1-Mx。研究亮点:首次通过干扰素诱生剂PolyI∶C诱导草鱼肾细胞的方法克隆得到了草鱼抗病毒基因Mx cDNA全序列,并且借助生物信息学软件对其编码的氨基酸进行了序列分析,还成功构建了真核表达载体pEGFP-C1-Mx,为进一步研究草鱼Mx蛋白的生物学活性及其在抗鱼类病毒性疾病中的应用奠定基础。
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文献信息
篇名 草鱼抗病毒基因Mx全长cDNA的克隆、序列分析与真核表达载体构建
来源期刊 上海海洋大学学报 学科 农学
关键词 草鱼 Mx基因 克隆 序列分析 载体构建
年,卷(期) 2012,(4) 所属期刊栏目 水产生物技术
研究方向 页码范围 502-508
页数 分类号 S917
字数 语种 中文
DOI
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 采克俊 湖州师范学院生命科学学院 42 139 7.0 9.0
2 刘莉 湖州师范学院生命科学学院 42 156 7.0 9.0
3 金佳丽 湖州师范学院生命科学学院 2 1 1.0 1.0
4 江晨 湖州师范学院生命科学学院 2 2 1.0 1.0
5 王改改 湖州师范学院生命科学学院 2 2 1.0 1.0
6 吴海丽 湖州师范学院生命科学学院 2 3 1.0 1.0
7 刘鹏 湖州师范学院生命科学学院 1 1 1.0 1.0
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Mx基因
克隆
序列分析
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研究起点
研究来源
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引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
上海海洋大学学报
双月刊
1004-7271
31-2024/S
大16开
上海市军工路334号
4-604
1992
chi
出版文献量(篇)
2427
总下载数(次)
5
总被引数(次)
28460
相关基金
浙江省自然科学基金
英文译名:
官方网址:http://www.zjnsf.net/
项目类型:一般项目
学科类型:
论文1v1指导