人Smac基因启动子区结合蛋白的生物信息学分析

• 作者: 于德新 廖贵益 张艳芝 方卫华
• 来源期刊: 安徽医科大学学报
• 学科: 医学
• 关键词: 线粒体促凋亡蛋白 启动子 转录因子
• 年，卷（期）: 2012,（3）
• 所属期刊栏目: 调查与分析
• 页码范围: 330-332
• 分类号: R34
• 字数: 2740字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-1492.2012.03.027

摘要

目的 分析线粒体促凋亡蛋白 (Smac)基因启动子区结合蛋白,预测其转录调控因子.方法 从基因参考序列数据库获取Smac基因启动子区序列,使用TFSEARCH程序对启动子序列中的转录因子结合位点进行预测.结果 成功获得了长度为2 kb的人Smac基因启动子区序列.该启动子区Threshold score≥90的共有71个转录因子结合位点,涉及STAT家族、bZIP家族、叉头蛋白家族、锌指蛋白Kruppel家族、POU家族、runt家族、MYB家族、GATA结合蛋白家族、SOX家族、同源异型框基因家族10个家族的转录因子和1个TATA box.结论 Smac表达的调控是在一定时间或空间上、一种或多种调节蛋白作用的复杂过程.调控Smac的转录因子绝大部分与胚胎发育、性别决定、个体生长密切相关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	于德新	安徽医科大学第一附属医院泌尿外科	135	383	10.0	15.0
2	方卫华	安徽医科大学第一附属医院泌尿外科	50	129	7.0	9.0
3	张艳芝	安徽医科大学第一附属医院泌尿外科	4	9	1.0	3.0
4	廖贵益	安徽医科大学第一附属医院泌尿外科	47	123	6.0	9.0