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小麦条锈菌实时荧光定量PCR分析中内参基因的选择
小麦条锈菌实时荧光定量PCR分析中内参基因的选择
作者:
冯浩
康振生
黄雪玲
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
内参基因
小麦条锈菌
小麦
实时荧光定量PCR
geNorm软件
摘要:
选择合适的内参基因是利用实时荧光定量PCR准确分析基因相对表达量的先决条件.基于现有对内参基因的研究,本研究挑选出10个基因作为小麦条锈菌(Puccinia striiformis f.sp.tritici)的候选内参基因.经过PCR扩增效率筛选,8个基因符合要求可用于稳定度的筛选,这些基因包括泛素连接酶(UBC、泛素连接酶E2(UBCE2)、核糖体蛋白SS(RPS5)、α微管蛋白(TUBA)、β肌动蛋白(ACTB)、β微管蛋白(TUBB)、延伸因子1(EF1)和延伸因子3(EF3).本研究以两种小麦条锈菌(CYR32和Pst78)的夏孢子、萌发芽管分别接种两个小麦(Triticum aestivam)品种(CYR32/XZ9104和Pst78/AvS)后0.5、3和14 d的样品为材料,利用实时荧光定量PCR技术,检测了这8个持家基因在不同发育阶段的小麦条锈菌中的表达情况.经geNorm软件分析发现,3个持家基因在样品中的表达趋势与小麦条锈菌的侵染过程相符合.ACTB、TUBB和TUBA的组合可作为检测小麦条锈菌基因表达的内参基因.
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篇名
小麦条锈菌实时荧光定量PCR分析中内参基因的选择
来源期刊
农业生物技术学报
学科
农学
关键词
内参基因
小麦条锈菌
小麦
实时荧光定量PCR
geNorm软件
年,卷(期)
2012,(2)
所属期刊栏目
研究报告
研究方向
页码范围
181-187
页数
分类号
S435.121
字数
5154字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1674-7968.2012.02.010
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
康振生
西北农林科技大学植物保护学院
142
2538
28.0
45.0
2
黄雪玲
西北农林科技大学植物保护学院
6
92
4.0
6.0
3
冯浩
西北农林科技大学植物保护学院
41
331
9.0
18.0
传播情况
被引次数趋势
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引文网络
引文网络
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参考文献(0)
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二级引证文献(0)
2013(5)
引证文献(5)
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二级引证文献(23)
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2018(17)
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2019(22)
引证文献(0)
二级引证文献(22)
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引证文献(2)
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小麦条锈菌
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实时荧光定量PCR
geNorm软件
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研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
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期刊影响力
农业生物技术学报
主办单位:
中国农业大学
中国农业生物技术学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1674-7968
CN:
11-3342/S
开本:
大16开
出版地:
北京海淀区圆明园西路2号中国农业大学生命科学楼1053室
邮发代号:
2-367
创刊时间:
1993
语种:
chi
出版文献量(篇)
4211
总下载数(次)
8
总被引数(次)
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