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布鲁菌外膜蛋白基因Omp22克隆测序及生物信息学分析
布鲁菌外膜蛋白基因Omp22克隆测序及生物信息学分析
作者:
李向阳
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
布鲁菌
Omp22基因
克隆
序列测定
生物信息学分析
摘要:
根据GenBank中的布鲁菌属特异性基因序列Omp22设计1对引物,以牛布鲁菌(Brucella)通辽市分离菌株染色体DNA作为模板,进行PCR扩增。将其定向插入克隆载体PGEM-7Zf,综合利用生物信息学软件(Danman和Vector NTI)、数据库(Prosite和PDB)和网络服务器对外膜蛋白Omp22进行基本性质分析、三维结构预测和功能预测。结果显示,用PCR方法扩增的Omp22基因长度为639bp,编码212个氨基酸,预测其蛋白质的相对分子质量约为22 000,同时用于预测B细胞线性表位的柔韧性和亲水性参数得到综合阐释,生物信息学预测和分析结果可为研究在布氏菌致病及机体免疫应答中外膜蛋白Omp22的结构与功能的关系提供丰富资料。
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文献信息
篇名
布鲁菌外膜蛋白基因Omp22克隆测序及生物信息学分析
来源期刊
中国兽医学报
学科
农学
关键词
布鲁菌
Omp22基因
克隆
序列测定
生物信息学分析
年,卷(期)
2012,(5)
所属期刊栏目
预防兽医学
研究方向
页码范围
670-674
页数
分类号
S852.61
字数
语种
中文
DOI
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
李向阳
内蒙古民族大学成人教育学院
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研究主题发展历程
节点文献
布鲁菌
Omp22基因
克隆
序列测定
生物信息学分析
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中国兽医学报
主办单位:
吉林大学
出版周期:
月刊
ISSN:
1005-4545
CN:
22-1234/R
开本:
大16开
出版地:
长春市西安大路5333号
邮发代号:
12-105
创刊时间:
1981
语种:
chi
出版文献量(篇)
7291
总下载数(次)
8
总被引数(次)
50005
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