三种不同抗冻性葡萄中 CBF2基因的生物信息学分析及植物表达载体构建

• 作者: 孙萍 张哲敏 李唯* 栗孟飞 王旺田 王雅琳
• 来源期刊: 广西植物
• 学科: 生物学
• 关键词: 葡萄 CB F2 转录激活因子 生物信息学分析 克隆 表达载体构建
• 年，卷（期）: 2013,（1）
• 页码范围: 82-88
• 分类号: Q7|Q943.2
• 字数: 3951字
• 语种: 中文

摘要

从赤霞珠、贝达和山葡萄三种不同抗冻性葡萄的基因组 DNA 中分别克隆了 CBF2全长基因,并利用生物信息学的方法进行了分析.结果显示:三种葡萄的 CBF2基因长均为969 bp ,编码253个氨基酸,与GeneBank 公布的的序列相比对,核苷酸相似性在96.7%~97.94%之间.生物信息学分析显示3种不同抗冻葡萄的 CB F2基因具有连续的开放阅读框,推倒的氨基酸序列具有 AP2结合域,初步判断克隆的 CB F2具有诱导抗寒性产生的作用.但氨基酸序列、进化树、理化性质、疏水性/亲水性等在抗寒性较强的山葡萄、贝达与抗寒性较差的赤霞珠之间存在一些差异,与 GenBank 上的原始序列同源性最低的是赤霞珠,而且其 CBF2 N端7个氨基酸残基序列与山葡萄和贝达的氨基酸序列存在较大差异,且具有较强的疏水性,这些差异可能与赤霞珠较弱的抗寒特性有关.以带有35S 启动子的载体 pBI121为基础,成功构建了植物表达载体 pBI121‐CaM V35S‐CBF2,为深入研究 CBF2基因在葡萄抗寒性中的作用提供了基础资料.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	栗孟飞	甘肃农业大学生命科学技术学院甘肃省干旱生境作物学重点实验室	28	201	9.0	14.0
2	王旺田	甘肃农业大学生命科学技术学院甘肃省干旱生境作物学重点实验室	48	382	12.0	17.0
3	孙萍	甘肃农业大学生命科学技术学院甘肃省干旱生境作物学重点实验室	14	96	6.0	9.0
4	张哲敏	甘肃农业大学生命科学技术学院甘肃省干旱生境作物学重点实验室	2	16	2.0	2.0
5	李唯*	甘肃农业大学生命科学技术学院甘肃省干旱生境作物学重点实验室	1	12	1.0	1.0