生物信息学研究豇豆胰蛋白酶抑制剂的致敏性

• 作者: 周催 孙娜 孙璐 王翠燕 车会莲
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 关键词: 豇豆胰蛋白酶抑制剂 潜在致敏性评价 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2013,（12）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 1473-1478
• 页数: 6页
• 字数: 4047字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2013.12.009

摘要

随着豇豆胰蛋白酶抑制剂基因(CpTI)近年来在棉花、水稻等农作物中的应用,CpTI在人类食物中的分布也日益广泛.作为一种外源蛋白,其致敏性越来越引起人们的关注,本研究对CpTI的潜在致敏性进行生物信息学分析,并与其他研究方法得到的结果进行比较,旨在进一步明确其潜在致敏性.在分析CpTI蛋白理化性质的基础上,使用DNAStar软件和Kolaskar-Tongaonkar在线服务器分别分析CpTI蛋白的抗原表位,同时使用致敏原在线数据库(Allergenonline)和致敏蛋白结构数据库(SDAP)中将CpTI氨基酸序列与己知致敏原序列进行比较分析其潜在致敏性.研究结果分析得到CpTI蛋白的抗原表位氨基酸区域可能为76～80,小于6个氨基酸,几乎不能形成抗原决定簇.另外,CpTI蛋白与己知致敏原中连续80个氨基酸的最高相似度为18.85％,没有发现CpTI具有与已知氨基酸序列完全相同的连续8个氨基酸.研究表明,抗原表位分析可以预测蛋白的免疫原性,而使用Allergenonline和SDAP数据库分析可以分析蛋白与己知致敏原之间的交叉反应性,从而预测其致敏性.采用这些方法对CpTI进行分析的结果显示,未发现其具有可形成抗原决定簇的抗原表位序列,与己知致敏原的相似度也没有达到产生交叉反应的程度.本研究显示,CpTI无致敏性或潜在致敏性很低,这将对使用生物信息学分析工具预测新型蛋白的潜在致敏性具有一定的参考意义.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	车会莲	中国农业大学食品科学与营养工程学院	41	207	7.0	13.0
2	孙娜	中国农业大学食品科学与营养工程学院	26	105	6.0	8.0
3	周催	中国农业大学食品科学与营养工程学院	15	59	6.0	7.0
4	孙璐	中国农业大学食品科学与营养工程学院	12	57	3.0	7.0
5	王翠燕	中国农业大学食品科学与营养工程学院	6	13	2.0	3.0