运用全基因组表达谱分析筛选肺腺癌不同TNM分期相关基因的研究

• 作者: 刘铭 夏涵 府伟灵 张峰 张晓莉 张永彪 张阳 潘虹
• 来源期刊: 中华检验医学杂志
• 关键词: 肺肿瘤 腺癌 肿瘤分期 基因表达谱 寡核苷酸序列分析
• 年，卷（期）: 2013,（12）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 1104-1108
• 页数: 5页
• 字数: 4741字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.1009-9158.2013.12.010

摘要

目的 比较不同TNM分期肺腺癌样本的基因表达谱,筛选中国人肺腺癌TNM分期相关的差异表达基因.方法 采用病例-病例研究.选取第三军医大学西南医院2008年5月至2011年10月经手术切除治疗的240例肺腺癌患者.其中90份患者标本(TNM Ⅰ期、Ⅱ期、ⅢA期各30例)用于芯片杂交,其余150份患者标本(TNM Ⅰ期、Ⅱ期、ⅢA期各50例)用于后续验证研究.应用商品化的博奥晶芯(R) 35K Oligo基因芯片比较90例不同TNM分期肺腺癌的基因表达谱,筛选与肺腺癌TNM分期相关的差异表达基因.从中挑选Zimp7、GINS2及NAG-1共3个差异表达基因,应用实时荧光定量RT-PCR方法进一步验证它们在肺腺癌组织标本中的表达情况.受检基因在各期中表达水平的比较采用方差分析.结果 肺腺癌组织中共筛选到592个显著差异表达基因;其中264个肺腺癌相关高表达基因和328个低表达基因.在这592个基因中,进一步筛选不同TNM分期(Ⅰ期、Ⅱ期、ⅢA期)样本间的差异表达基因,共获得10个显著差异表达基因.实时荧光定量RT-PCR方法验证结果与芯片结果基本一致.结论 本研究共筛选到10个中国人肺腺癌TNM分期相关作用基因,预期将为揭示肺腺癌发生发展的内在作用机制,寻找肺腺癌诊断、治疗、预后判断的新靶点提供思路.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	府伟灵	第三军医大学西南医院基因诊断治疗中心	406	5132	33.0	56.0
2	张峰	中国科学院北京基因组研究所	149	3496	30.0	56.0
3	张晓莉	第三军医大学西南医院基因诊断治疗中心	25	113	6.0	9.0
4	夏涵	第三军医大学西南医院基因诊断治疗中心	35	404	10.0	19.0
5	刘铭	第三军医大学大坪医院心外科	17	49	4.0	6.0
6	张阳	第三军医大学西南医院基因诊断治疗中心	17	80	5.0	8.0
7	潘虹	第三军医大学西南医院基因诊断治疗中心	7	27	3.0	5.0
8	张永彪	中国科学院北京基因组研究所	2	11	1.0	2.0