微小隐孢子虫20K亲环蛋白基因克隆及分析

• 作者: 付芹芹 孙小会 张丽菊 杨光 王穗湘 荆春霞 郭志云 陈川
• 来源期刊: 中国公共卫生
• 学科: 医学
• 关键词: 微小隐孢子虫(Cp) CyP基因 克隆 生物信息学
• 年，卷（期）: 2013,（1）
• 所属期刊栏目: 实验研究
• 页码范围: 58-61
• 分类号: R531.5
• 语种: 中文

摘要

目的 克隆微小隐孢子虫(Cp)南京株(NJ)的20K亲环蛋白(CyP)基因,并对其核苷酸和氨基酸序列进行分析.方法 采用昆明种小鼠建立微小隐孢子虫NJ株感染模型,根据微小隐孢子虫Iowa Ⅱ株20K CyP基因序列设计合成2对引物,应用巢式PCR技术从微小隐孢子虫NJ株基因组DNA中扩增20K CyP基因,并将其克隆到pMD18-T载体上,将阳性克隆重组质粒进行菌落PCR及双酶切鉴定;应用生物信息学方法分析微小隐孢子虫NJ株20K CyP基因与其他虫株核苷酸和氨基酸序列差异,并分析该基因蛋白结构域.结果 巢式PCR扩增得到特异的20K CyP基因,经PCR及双酶切鉴定获得了正确的pMD18-T-20K CyP重组质粒;测序结果显示,微小隐孢子虫NJ株20K CyP基因全长519 bp,编码173个氨基酸,该基因已登录GenBank,登录号为JQ284431;氨基酸序列分析表明,微小隐孢子虫NJ株与Iowa Ⅱ株20K CyP基因编码的氨基酸序列具有100％同源性;对20K Cyp基因进行蛋白结构域分析,显示该基因序列所编码的蛋白具有特异性类亲环蛋白A、B、H的肽脯氨酰顺反异构酶(PPIase)区域,该区域与人的亲环蛋白A、B、H具有相似性.结论 成功克隆微小隐孢子虫NJ株20K CyP基因,该基因具有高度保守性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨光	暨南大学医学院人体寄生虫学系	31	186	8.0	13.0
2	荆春霞	暨南大学医学院流行病学教研室	91	1611	22.0	37.0
3	付芹芹	暨南大学医学院流行病学教研室	8	32	2.0	5.0
4	郭志云	暨南大学医学院人体寄生虫学系	7	7	1.0	1.0
5	孙小会	暨南大学医学院流行病学教研室	6	7	1.0	1.0
6	王穗湘	暨南大学医学院人体寄生虫学系	8	15	2.0	3.0
7	张丽菊	暨南大学医学院流行病学教研室	5	13	2.0	3.0
8	陈川	暨南大学医学院人体寄生虫学系	6	13	2.0	3.0