水仙 SSR 分子标记 PCR 反应体系的建立与优化

• 作者: 佘文琴 潘东明 潘腾飞 祁世明
• 来源期刊: 福建林学院学报
• 学科: 农学
• 关键词: 水仙 简单重复序列 体系优化 正交设计 多重比较
• 年，卷（期）: 2014,（2）
• 页码范围: 158-164
• 页数: 7页
• 分类号: S682.2+1
• 字数: 4638字
• 语种: 中文

摘要

利用单因素梯度试验与正交试验相结合、方差分析与多重比较分析相结合的方法，对水仙简单重复序列-聚合酶链式反应（ SSR-PCR）扩增反应体系中的4个因素（ DNA、dNTPs、引物及Taq酶）进行优化分析，方差分析表明4个因素对SSR-PCR的影响均达到极显著水平，通过多重比较分析发现SSR引物和Taq酶对总体系的扩增结果影响最大。根据单因素梯度试验与正交试验结果，建立了适合水仙SSR标记分析的最优PCR反应体系：DNA模板2．5 ng·μL-1，10×PCR Buffer （含1．5 mmol· L-1 Mg2＋），dNTPs 0．25 mmol· L-1，上下游引物各0．50μmol· L-1，Taq酶1．00 U，总体积20μL。该优化体系的建立可为今后水仙SSR分析提供标准化的试验体系，为水仙种质鉴定、品种指纹图谱绘制、遗传多样性分析、群居遗传结构研究和遗传连锁图谱分析等领域提供技术支持。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	潘东明	福建农林大学园艺学院	201	1594	19.0	27.0
5	佘文琴	福建农林大学园艺学院	43	278	9.0	16.0
9	潘腾飞	福建农林大学园艺学院	41	290	10.0	16.0
13	祁世明	福建农林大学园艺学院	1	1	1.0	1.0