甘薯褪绿矮化病毒西非株系实时荧光定量PCR检测方法的建立及应用

• 作者: 乔奇 张德胜 张振臣 张立军 王丽 王振东 王爽 田雨婷 秦艳红
• 来源期刊: 植物病理学报
• 学科: 农学
• 关键词: 甘薯褪绿矮化病毒西非株系 荧光探针 实时荧光定量PCR
• 年，卷（期）: 2014,（5）
• 所属期刊栏目: 病原学
• 页码范围: 461-468
• 页数: 8页
• 分类号: S432.41
• 字数: 4402字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13926/j.cnki.apps.2014.05.003

摘要

依据GenBank中登录的甘薯褪绿矮化病毒(Sweet potato chlorotic stunt virus,SPCSV)西非株系(WA)的核苷酸序列,分别设计两对特异性引物和一条TaqMan探针.以SPCSV-WA外壳蛋白(cp)基因的重组质粒为阳性标准质粒绘制标准曲线,通过优化反应体系和反应条件,建立了SPCSV-WA的实时荧光定量PCR检测方法.试验结果表明,该方法只能检测到目的病毒,标准曲线的斜率和相关系数分别为-3.239和1,扩增效率为103.568％.最低可检测到约3.31 copies/μL的阳性质粒,灵敏度比常规PCR高1000倍.本研究建立的SPCSV实时荧光定量PCR方法可用于田间样品的检测,为SPCSV的早期预警和流行学研究提供了技术手段.