青杄PwUSP1基因的克隆及表达模式分析

• 作者: 孙帆 崔晓燕 张世宏 张凌云 李长江
• 来源期刊: 植物生理学报
• 关键词: 青杄 PwUSP1 生物信息学分析 组织表达 胁迫响应
• 年，卷（期）: 2014,（4）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 407-414
• 页数: 8页
• 语种: 中文

摘要

广泛逆境胁迫蛋白(universal stress protein, USP)在非生物胁迫响应中起重要作用,但在植物中其功能还大部分未知。本研究通过BLAST分析青杄EST文库,得到USP基因的EST序列,通过RACE PCR方法获取USP基因的末端序列,经过与EST序列拼接得到USP基因的cDNA全长序列,命名为PwUSP1。分析发现PwUSP1全长cDNA为1167 bp,编码区为519 bp,编码172个氨基酸残基。生物信息学分析显示, PwUSP1编码的蛋白相对分子质量为19.07 kDa,理论等电点为6.38,为非跨膜的亲水性蛋白。PwUSP1具有USP家族典型的UspA结构域和ATP结合位点G-(2X)-G-(9X)-G(S/T)。半定量RT-PCR 与RT-qPCR分析表明, PwUSP1在青杄的根、茎、针叶、花粉、种子中均有表达,在根和花粉中表达量较高。同时, PwUSP1受干旱和盐胁迫的诱导表达上调,均在处理6h后表达量较高,推测该基因可能在青杄逆境胁迫响应中发挥作用。