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青杄Pw WrbA基因克隆及表达分析
青杄Pw WrbA基因克隆及表达分析
作者:
周燕妮
张凌云
张通
李长江
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
青杄
WrbA基因
生物信息学
组织表达
胁迫响应
摘要:
色氨酸阻遏结合蛋白(tryptophan repressor-binding protein,WrbA)是一种重要的抗氧化酶类,参与了多种逆境反应.笔者通过RACE-PCR的方法克隆得到青杆WrbA基因的cDNA全长,共1 045 bp,编码区651 bp,编码203个氨基酸.利用生物信息学工具对其进行理化性质、二级结构和三级结构的分析,该蛋白理论分子质量21.80 ku,pI值6.43,N端11-15位氨基酸和C端112-165位氨基酸是FMN结合位点.荧光定量PCR和半定量RT-PCR发现青杆PwWrbA在各组织中都有表达,但在针叶中表达量最高.同时,PwWrbA在NaCl和ABA胁迫处理后表达量升高,H2O2也会影响其表达的改变,H2O2处理6h后表达量上调.因此,PwWrbA是一个新的WrbA基因,推测其可能在青杆逆境胁迫应答中发挥作用.
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MYB转录因子
基因克隆
胁迫响应
基因表达
青杆CYP1基因的克隆与表达
青杄
亲环素蛋白
CYP1基因
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文献信息
篇名
青杄Pw WrbA基因克隆及表达分析
来源期刊
南京林业大学学报(自然科学版)
学科
农学
关键词
青杄
WrbA基因
生物信息学
组织表达
胁迫响应
年,卷(期)
2014,(4)
所属期刊栏目
研究论文
研究方向
页码范围
34-38
页数
5页
分类号
Q78|S792
字数
4096字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1000-2006.2014.04.007
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
李长江
北京林业大学省部共建森林培育与保护教育部重点实验室
9
65
4.0
8.0
2
张通
北京林业大学省部共建森林培育与保护教育部重点实验室
5
9
2.0
3.0
3
张凌云
北京林业大学省部共建森林培育与保护教育部重点实验室
39
174
8.0
12.0
4
周燕妮
北京林业大学省部共建森林培育与保护教育部重点实验室
4
7
1.0
2.0
传播情况
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节点文献
青杄
WrbA基因
生物信息学
组织表达
胁迫响应
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
南京林业大学学报(自然科学版)
主办单位:
南京林业大学
出版周期:
双月刊
ISSN:
1000-2006
CN:
32-1161/S
开本:
大16开
出版地:
南京市龙蟠路159号南京林业大学
邮发代号:
28-16
创刊时间:
1958
语种:
chi
出版文献量(篇)
4299
总下载数(次)
8
总被引数(次)
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南京林业大学学报(自然科学版)1999
南京林业大学学报(自然科学版)1998
南京林业大学学报(自然科学版)2014年第z1期
南京林业大学学报(自然科学版)2014年第6期
南京林业大学学报(自然科学版)2014年第5期
南京林业大学学报(自然科学版)2014年第4期
南京林业大学学报(自然科学版)2014年第3期
南京林业大学学报(自然科学版)2014年第2期
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