利用目标基因测序技术发现马方综合征FBN1新突变

• 作者: 李小燕 杜杰 王绿娅 蔡伦 郭俊
• 来源期刊: 心肺血管病杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 马方综合征 原纤维蛋白-1 目标基因捕获 第二代测序
• 年，卷（期）: 2014,（4）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 596-598,603
• 页数: 4页
• 分类号: R54
• 字数: 2601字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1007-5062.2014.04.032

摘要

目的:建立目标基因捕获结合第二代测序技术,对马方综合征(Marfan syndrome,MFS)患者的原纤维蛋白-1(fibrillin-1,FBN1)基因进行突变筛查,探讨MFS与FBN1基因突变的关系.方法:提取5例MFS患者外周血全基因组DNA,利用GenCap目标基因捕获技术(北京迈基诺公司),设计FBN1的65个外显子区域特异性捕获探针,与基因组DNA文库进行杂交,将目标基因组区域的DNA片段进行富集后,再利用illumina hiseq2000第二代测序仪进行测序,通过数据分析,确定突变位点,用Sanger测序法对突变位点进行验证.结果:设计合成的目标基因特异性捕获探针可有效地捕捉并富集基因组DNA的目标靶片段.5例患者目标区域平均测序深度为173.85 ～ 280.73,97.10％ ～ 98.00％目标区域＞4×覆盖度.经过数据分析及Sanger测序验证,发现1个新的无义突变c.5968 C＞T(p.Gln1990X).结论:本研究所建立的GenCap目标基因捕获技术结合illumina hiseq2000第二代测序技术成功的发现了FBN1的新突变.该方法快速而有效,可以使我们对MFS分子病因学有更好的认识.