毛白杨真菌胁迫下miRNA靶基因预测和生物信息分析

• 作者: 叶梅霞 安新民 廖维华 陈仲 雷炳琪 马焕弟 高凯
• 来源期刊: 中国细胞生物学学报
• 关键词: 毛白杨 真菌胁迫 miR393 靶基因
• 年，卷（期）: 2014,（11）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 1506-1513
• 页数: 8页
• 语种: 中文
• DOI: 10.11844/cjcb.2014.11.0194

摘要

目前,关于杨树在真菌胁迫下其miRNAs对基因的调控作用研究较少.准确快速地预测并鉴定miRNA靶基因,对揭示真菌胁迫下miRNAs在基因调控中的作用至关重要.该文根据miRNA的进化保守性,通过靶基因预测软件psRNATarget,以已知的毛果杨miRNAs为探针,与毛白杨真菌胁迫下转录组的基因序列比对,找到其中347个miRNAs的772个靶基因,分别编码与植物激素信号传导、植物病原互作、谷胱甘肽代谢等与植物抗病密切相关的蛋白.miR393通过转录后水平作用于靶基因,调节生长素信号以响应多种外界刺激.该研究发现了miR393的11个靶基因,主要参与生长素介导的信号通路;其中6个靶基因(SD1-13、CYP83B1、AFB2、TIR1、AFB3和PSBR)存在差异表达,这些基因是研究miR393的生物学功能的关键候选基因.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	安新民		30	648	10.0	25.0
2	陈仲		10	5	2.0	2.0
3	叶梅霞		5	5	2.0	2.0
4	廖维华		2	15	1.0	2.0
5	雷炳琪		3	6	1.0	2.0
6	高凯		5	14	2.0	3.0
7	马焕弟		1	0	0.0	0.0