毛果杨Eukaryotic translation initiation factor 5A(eIF5A)同源基因的生物信息学分析

• 作者: 曲冠证 李爽 臧丽娜 邵龙婷 郑唐春
• 来源期刊: 安徽农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 毛果杨 eIF5A 生物信息学
• 年，卷（期）: 2014,（1）
• 所属期刊栏目: 林学
• 页码范围: 141-149
• 分类号: Q75|S792.11
• 语种: 中文

摘要

为研究毛果杨eIF5A基因间的同源性及其进化关系,以毛果杨的eIF5A基因为研究对象,利用生物信息学软件及网站对其进行碱基分布、氨基酸组成、亲疏水性、保守区以及二级结构和三级结构的预测与分析,并与其他物种的eIF5A氨基酸序列进行多重比对与进化分析.结果表明,4个毛果杨eIF5A基因定位于不同染色体上,且都只含有5个外显子;研究还发现不同成员间氨基酸数目、氨基酸序列间的疏水性存在一定的差异;亚细胞定位分析表明,4个eIF5A蛋白均定位于细胞质上;二级结构预测结果显示,4个eIF5A氨基酸序列以无规则卷曲、扩展链和α-螺旋为主要组成部分,且4条氨基酸序列三维结构十分相似.上述结果均为毛果杨eIF5A基因家族的进一步功能分析提供了一定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郑唐春	东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室	18	34	4.0	5.0
2	曲冠证	东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室	31	54	5.0	5.0
3	李爽	东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室	29	138	6.0	11.0
4	臧丽娜	东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室	12	23	4.0	4.0
5	邵龙婷	东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室	1	5	1.0	1.0