牛支原体分离株全基因组序列测定及初步分析

• 作者: 关平原 吴太平 李平安 王艳杰
• 来源期刊: 动物医学进展
• 学科: 农学
• 关键词: 牛支原体 酚-氯仿提取法 全基因组测序
• 年，卷（期）: 2014,（8）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 44-48,49
• 页数: 6页
• 分类号: S852.62
• 字数: 4480字
• 语种: 中文

摘要

为全面了解牛支原体NM2012株的基因序列，研究其潜在的致病机制及其复制、转录、翻译过程的调控机制，采用体外大量培养，酚-氯仿法提取牛支原体NM2012株基因组DNA，并送往北京华大基因公司进行全基因组测序注释。结果显示，牛支原体NM2012株基因组大小为993483bp，GC含量为29．26％，测序组装后共产生3个scaffolds，24个contigs。基因组组分分析后发现，NM2012株的基因组含有885个基因，总长度为834042bp，基因平均长度为942bp，占基因组全长的83．95％。串联重复序列共79个，总长为9203bp，占基因组全长的0．9263％。小卫星序列53个，微卫星序列5个，tRNA34个，rRNA4个。牛支原体NM2012株16SrRNA序列与支原体属致牛羊病主要菌株构建进化树进一步证实NM2012株为牛支原体，为后期进一步研究牛支原体提供依据。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	关平原	内蒙古农业大学兽医学院农业部动物临床诊疗技术重点实验室	58	314	10.0	15.0
2	李平安	内蒙古农业大学兽医学院农业部动物临床诊疗技术重点实验室	22	151	8.0	12.0
3	吴太平	内蒙古农业大学食品科学与工程学院	3	20	2.0	3.0
4	王艳杰	内蒙古农业大学兽医学院农业部动物临床诊疗技术重点实验室	2	21	2.0	2.0