扁桃CBF1基因的克隆与生物信息学分析

• 作者: 代培红 张亮 张智俊 李疆 田嘉 罗淑萍
• 来源期刊: 中国农学通报
• 学科: 生物学
• 关键词: 扁桃 克隆 CBF1 生物信息学
• 年，卷（期）: 2014,（34）
• 所属期刊栏目: 林学·园艺
• 页码范围: 16-23
• 分类号: Q785
• 语种: 中文

摘要

为揭示CBF基因在扁桃抗逆机制中发挥的功能,对扁桃CBF1基因进行克隆与分析.以新疆扁桃主栽品种‘鹰嘴’为材料,根据已经报道的CBF1基因序列设计引物,通过PCR技术从扁桃基因组DNA中获得CBF1基因,命名为YZ-AcCBF1,并已登录GenBank(登录号KJ818900).经生物信息学分析,该基因开放阅读框为729 bp,编码242个氨基酸,分子式为C1195H1886N346O368S13相对分子质量为27.405 kDa,等电点为7.69,半衰期为30h,脂肪系数为63.72,疏水性平均值为-0.646.对其亚细胞定位、跨膜结构、信号肽及疏水性/亲水性进行分析,表明其定位在细胞核,不存在跨膜结构,为非分泌性亲水蛋白.系统发育分析结果显示其与桃(AGS 13699)的亲缘关系最近.二级结构预测显示该蛋白主要由26.86％的α螺旋和58.68％的无规卷曲组成.三维结构预测表明其符合AP2结构域模型特点.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李疆	新疆农业大学林学与园艺学院	209	2704	28.0	40.0
2	罗淑萍	新疆农业大学农学院	152	1655	22.0	30.0
3	代培红	新疆农业大学农学院	54	169	7.0	9.0
4	张亮	新疆农业大学农学院	8	23	3.0	4.0
5	田嘉	新疆农业大学林学与园艺学院	32	104	6.0	8.0