一株伯克氏菌中两个阿魏酸酯酶的比较分析

• 作者: 刘盼 徐振上 杨晓颖
• 来源期刊: 齐鲁工业大学学报
• 学科: 生物学
• 关键词: Burkholderia phytofirmans 阿魏酸酯酶 结构预测
• 年，卷（期）: 2015,（2）
• 页码范围: 45-48
• 页数: 4页
• 分类号: Q-9
• 字数: 1729字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16442/j.cnki.qlgydxxb.2015.02.011

摘要

本文从NCBI数据库中检索得到Burkholderia phytofirmans PsJN的两个阿魏酸酯酶基因序列,分别标记为Bpfae1和Bpfae2,运用生物信息学方法对其核苷酸序列、编码的氨基酸序列进行分析,并对其二级和三级结构进行预测。结果表明,Bpfae1的基因全长为1671bp,该基因编码的氨基酸为556aa,此蛋白质的等电点为8.33,分子量为59978.22Da。 Bpfae2的基因全长为1734bp,该基因编码的氨基酸为577aa,此蛋白质的等电点5.42,分子量为59339.25Da。序列比对结果表明, Bpfae1与 Burkholderia xenovorans 同源性最高为90％。 Bpfae2与 Burkholderia glumae同源性最高为83％,这两个阿魏酸酯酶蛋白的同源率为29％。另外对这两个阿魏酸酯酶的立体结构进行了同源模拟。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨晓颖	齐鲁工业大学生物工程学院	5	6	1.0	2.0
2	徐振上	山东大学微生物技术国家重点实验室	1	0	0.0	0.0
3	刘盼	齐鲁工业大学生物工程学院	3	3	1.0	1.0