中介蝮蛇毒L-氨基酸氧化酶基因的生物信息学分析

• 作者: 孙悦 张翠 杨章民 王芳霞 郭积芳
• 来源期刊: 陕西师范大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 中介蝮 L-氨基酸氧化酶 基因 生物信息学
• 年，卷（期）: 2015,（5）
• 所属期刊栏目: 生命科学
• 页码范围: 71-75
• 页数: 5页
• 分类号: Q811.4|Q71
• 字数: 3498字
• 语种: 中文
• DOI: 10.15983/j.cnki.jsnu.2015.05.355

摘要

采用生物信息学方法,对中介蝮蛇毒L-氨基酸氧化酶(GI-LAO)基因进行了分析.结果表明:GI-LAO基因所包含的开放阅读框为1 515 bp,编码504个氨基酸残基;GI-LAO一级结构与白眉蝮GH-LAO的相似性最高,达99％;N-端的18个氨基酸残基为信号肽,成熟肽含486个氨基酸残基,相对分子质量为55.1 kDa,理论等电点为6.55;该蛋白含有两个结构域:FAD结合域(56-123位氨基酸残基)和催化结构域(61～499位氨基酸残基);与白眉蝮GH-LAO序列比对发现,有4个氨基酸位点存在差异(分别是20、56、99和467位氨基酸残基),用SIFT软件分析表明,这四个位点对其功能无影响;该基因编码的氨基酸序列有2个活性位点(H242和R343),2个N-糖基化位点(N190和N379),5个位点(R108、H241、Y390、G482和W483)与底物结合有关,4个保守半胱氨酸残基形成两对二硫键(C28-C191和C349-C430);三维结构建模结果表明,GI-LAO形成同源二聚体,每个单体由22个α-螺旋,22个β-折叠股和一些无规则卷曲、转角等形成三个结构域:FAD结合域,底物结合域以及α-螺旋域;在GI-LAO蛋白的进化分析中,中介蝮GI-LAO与白眉蝮GH-LAO的亲缘关系最近.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨章民	陕西师范大学生命科学学院	47	201	6.0	12.0
2	孙悦	陕西师范大学生命科学学院	3	1	1.0	1.0
3	郭积芳	陕西师范大学生命科学学院	2	8	1.0	2.0
4	张翠	陕西师范大学生命科学学院	4	1	1.0	1.0
5	王芳霞	陕西师范大学生命科学学院	1	1	1.0	1.0