广西地区人类免疫缺陷病毒-1流行毒株g ag 基因系统进化和基因变异特征分析

• 作者: 刘洁 叶力 周波 李旭 梁冰玉 梁浩 王敏连 王洪 赵芳凝 陈荣凤
• 来源期刊: 中华传染病杂志
• 关键词: 人类免疫缺陷病毒-1 基因 ,gag 变异(遗传学)
• 年，卷（期）: 2015,（8）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 485-489
• 页数: 5页
• 字数: 3059字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.1000-6680.2015.08.009

摘要

目的：了解广西壮族自治区 HIV‐1流行毒株 gag基因分子进化及遗传变异特征。方法收集2011年10月至2012年3月广西地区 HIV‐1感染者血液样本158份，采用反转录／套式PCR对HIV‐1 gag基因片段进行扩增并测序。运用M EGA 5．03构建系统进化树，并计算 gag区及各编码区段的基因离散率和选择压力（globle ω）。两样本基因离散率的比较采用两独立样本 t检验，多个样本的基因离散率比较采用单因素方差分析。结果158份样本中获得140条 gag基因序列，存在4种亚型：CRF＿01AE 80份（57．1％），CRF08＿BC 46份（32．9％），CRF07＿BC 10份（7．1％），B （B′）4份（2．9％）。gag基因离散率在 CRF＿01AE 亚型为0．036±0．001，CRF08＿BC 亚型为0．031±0．002， CRF07＿BC亚型为0．043±0．003，B （B′）亚型为0．102±0．006，差异有统计学意义（ F＝220．62，P＜0．01）。p17和 p24编码区均受到负向选择压力作用，globle ω＜1。各亚型 p17编码区的globle ω值相近，差异无统计学意义（ F＝0．761，P＝0．469），p24编码区的 g lo ble ω值差异也无统计学意义（ F＝0．037，P＝0．964）。结论广西地区 HIV‐1亚型以CRF＿01AE为主，gag基因各编码区段在进化上相对保守，但HIV‐1流行特征的变化可能会影响 gag基因的遗传变异，应继续追踪检测。