先天性小耳畸形差异性长链非编码RNA表达谱与生物信息学分析

• 作者: 宋宇鹏 张玲 杨庆华 林琳 毕晔 潘博 蒋海越
• 来源期刊: 中国优生与遗传杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 先天性小耳畸形 长链非编码RNA 基因芯片
• 年，卷（期）: 2015,（10）
• 所属期刊栏目: 分子遗传学与生化遗传学
• 页码范围: 23-26
• 页数: 4页
• 分类号: R764.71
• 语种: 中文

摘要

目的 探讨分析先天性小耳畸形差异性长链非编码RNA (lncRNA)的表达谱与生物信息学分析.方法 采用Arraystar高通量lncRNAs基因芯片研究3例先天性小耳畸形的患者的小耳侧残耳软骨与正常侧耳软骨,获得lncRNAs差异性表达谱.结果 本实验所用的基因芯片包含30 586个lncRNAs和26 1 09个mRNAs探针;与正常侧软骨比较,残耳软骨共检测出差异性表达LncRNAs共有180条,其中表达上调的LncRNAs有74条,表达下调的LncRNAs有106条.信号通路分析显示涉及到甘油酯类代谢、破骨细胞分化、肿瘤生长等.结论 先天性小耳畸形存在明显的lncRNAs差异性表达,这些lncRNAs及某些信号通路可能在小耳畸形发生和发展中发挥重要作用.