山核桃种子脂肪代谢期EST序列的初步分析

• 作者: 周秦 夏国华 曾燕如 黄有军 黄银芝
• 来源期刊: 浙江农林大学学报
• 关键词: 经济林学 山核桃 表达序列标签 功能分类 脂肪代谢 蛋白分析
• 年，卷（期）: 2015,（2）
• 页码范围: 229-236
• 页数: 8页
• 分类号: S722.3|Q753
• 语种: 中文
• DOI: 10.11833/j.issn.2095-0756.2015.02.009

摘要

山核桃Carya cathayensis为重要的油料干果树种,其非同一般的高含油率必定有其特殊的成油机制.为探索其成油机制,在已构建的山核桃脂肪代谢相关cDNA文库基础上,对cDNA进行随机克隆测序,对序列进行拼接、功能注释,基因本体论(gene ontology,GO)分类及基于拟南芥Arab idopsis thaliana的FunCat分类,并对与脂肪代谢相关的全长cDNA序列进行蛋白性质分析.结果共得到1 010条山核桃表达序列标签(ESTs),经拼接获得188个编码蛋白质的基因(unigene),其中92个contigs和96个singlets.GO分类将这些unigene分成细胞组分、分子功能和生物过程等3类,并发现各序列编码的基因并不承担单一的功能,有些序列在功能上有重叠;同时参照拟南芥的基因功能分类,将unigene序列在功能上分成9类,得到了143个全长cDNA序列,其中包括14个与脂肪代谢相关的cDNA序列.对12个与脂肪代谢相关的全长cDNA序列进行蛋白性质分析,发现它们均具有磷酸化位点;除油质蛋白外都没有跨膜区域,且不具信号肽结构,为非分泌蛋白,属于某个蛋白家族;不同的油体蛋白具有不同的跨膜区,且均具有信号肽结构,属于Oleosin super family蛋白家族.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	周秦		15	38	4.0	5.0