甘蔗ScBAK1基因及其可变剪接体的克隆与表达分析

• 作者: 凌辉 刘峰 张玉叶 肖新换 苏炜华 阙友雄 黄宁 黄珑
• 来源期刊: 应用与环境生物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 甘蔗 BAK1基因 可变剪接 生物信息学 荧光定量PCR
• 年，卷（期）: 2015,（5）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 872-881
• 页数: 10页
• 分类号: Q78|S566.103.4
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1145.2015.03005

摘要

可变剪接(Alternative splicing,AS)是真核生物基因表达调控研究的热点.BAK1(Brassinosteroid insensitive1-associated receptor kinase 1)是植物中丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶的一种,可调控植物的生长发育及先天免疫反应.为揭示BAK1基因在甘蔗应答不良外界环境方面的作用,利用电子克隆及RT-PCR方法从甘蔗品种崖城05-179叶片cDNA中克隆到1个BAK1基因及其1个可变剪接体,分别命名为ScBAK1(GenBank登录号:KP032226)和ScBAK1 SI(GenBank登录号:KP032227).生物信息学分析结果表明,ScBAK1/ScBAK1 SI基因的ORF长1 860 bp/1 770 bp,编码蛋白含有619/589个氨基酸残基,分子量(Mr)为6.928×104/6.576×104;两种编码蛋白均定位于质膜上,含有信号肽,为酸性、分泌脂溶性蛋白;它们的二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主,其次是延伸链,无β-螺旋;蛋白功能预测显示其主要作为细胞膜蛋白,还参与氨基酸及辅酶因子生物合成.荧光定量PCR分析结果显示,ScBAK1SI基因的表达在非生物(水杨酸SA、CuC12、PEG、脱落酸ABA、NaC1、茉莉酸甲酯JA)和生物胁迫(黑穗病菌)下均受到抑制,而ScBAK1却受SA、CuC12、PEG、NaC1和黑穗病菌的诱导.结果还表明,相较于ScBAK1在甘蔗抗黑穗病性、渗透胁迫以及细胞生长方面发挥作用来说,ScBAK1 S1缺失的氨基酸序列或数目在ScBAK1的抗逆性方面扮演了重要角色.cBAK1和ScBAK1S1的不同丰度表达为深入解析ScBAK1基因在生物和非生物逆境条件下的功能奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	阙友雄		41	502	13.0	21.0
2	刘峰		21	118	6.0	10.0
3	黄宁		8	29	2.0	5.0
4	凌辉		7	6	1.0	2.0
5	苏炜华		5	0	0.0	0.0
6	黄珑		3	0	0.0	0.0
7	肖新换		3	0	0.0	0.0
8	张玉叶		2	0	0.0	0.0