胃癌相关长链非编码RNA的生物信息学筛选

• 作者: 何姝仪 张文玲 李淑娜 李超然 邹国英 陈淑敏
• 来源期刊: 临床检验杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 胃癌 长链非编码RNA 生物信息学
• 年，卷（期）: 2015,（10）
• 所属期刊栏目: 研究生园地
• 页码范围: 789-792
• 页数: 4页
• 分类号: R735.3
• 字数: 2679字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13602/j.cnki.jcls.2015.10.20

摘要

目的 用生物信息学方法筛选胃癌中差异表达的长链非编码RNA.方法 于NCBI公共数据平台GEO下载胃癌基因芯片数据GSE33335,用SAM软件对其进行差异表达分析,对差异表达基因进行重注释并筛选其中的长链非编码RNA,用Gene Cluster和Tree View软件对筛选出的长链非编码RNA的表达情况予以验证.结果 针对该芯片数据,筛选出胃癌中差异表达的非编码RNA 15个,其中,表达上调的12个,表达下调的3个,这15个非编码RNA表达值倍数均＞2或＜0.5(q均＜0.05).结论 用生物信息学方法筛选胃癌相关的长链非编码RNA是一种非常高效的手段,能为胃癌相关肿瘤标志物的探索提供理论依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张文玲	中南大学湘雅医学院医学检验系	32	211	9.0	13.0
2	陈淑敏	中南大学湘雅医学院医学检验系	4	31	2.0	4.0
3	李淑娜	中南大学湘雅医学院医学检验系	5	25	3.0	5.0
4	邹国英	中南大学湘雅医学院医学检验系	2	9	2.0	2.0
5	李超然	中南大学湘雅医学院医学检验系	1	7	1.0	1.0
6	何姝仪	中南大学湘雅医学院医学检验系	2	7	1.0	2.0