不同尾型绵羊全基因组选择信号检测

• 作者: 刘瑞凿 刘真 吴明明 张淑珍 张莉 杜立新 王慧华 赵福平 魏彩虹
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 全基因组 选择信号 候选基因 脂肪沉积 群体分化指数(FST)
• 年，卷（期）: 2015,（10）
• 所属期刊栏目: 遗传繁育
• 页码范围: 1721-1732
• 页数: 12页
• 分类号: S826.2
• 字数: 8880字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2015.10.004

摘要

为研究不同尾型绵羊群体遗传分化程度,检测全基因组选择信号,以挖掘不同尾型绵羊重要性状相关的候选基因.本研究基于蒙古羊(短脂尾)和藏羊(瘦尾)群体的Illumina Ovine SNP 50K芯片分型数据,借助遗传分化系数FST法进行群体间选择信号检测,寻找选择信号区域内的重要基因,并对其中与脂肪代谢相关的基因PPARG、PDGFD在呼伦贝尔羊(大尾和小尾品系;肥尾)与藏羊(瘦尾)尾脂进行mRNA相对表达量研究.结果,(1)465个SNPs被选择,基因注释找到448个候选基因,筛选到50个与脂类代谢相关的基因,GO功能富集分析发现,主要富集在脂类生物合成过程、磷脂代谢、脂质结合等条目,此外发现4个基因(PPARG、RXRG、SLC27A2和ACSL6)富集到PPAR信号通路.(2)肥瘦尾之间,呼伦贝尔羊(大尾和小尾品系)PPARG和PDGFD基因表达量均显著高于藏羊(P＜0.01),而大小肥尾之间,呼伦贝尔羊大尾品系PPARG基因表达量显著高于小尾品系(P＜0.05),PDGFD基因表达量则无明显差异.通过FST法有效检测到受选择的基因,部分与绵羊重要性状相关,相对定量试验证明PPARG和PDGFD基因与尾部脂肪沉积密切相关,可以作为尾型选育的候选基因,为绵羊育种及改良提供重要参考.